Bioquimica

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La estructura, dinámica y unión de la pareja de módulos LA45 del receptor de lipoproteína de baja densidad sugieren un importante papel en la versión para LA4 ligando
Miklos Guttman y Elizabeth A.Komives *
Departamento de Química y Bioquímica de la Universidad de California en San Diego, 9500 Gilman Drive, La Jolla, California 92093-0378, Estados Unidos
Bioquímica, el artículo lo antesposible
DOI: 10.1021/bi2014486
Fecha de publicación (web): 17 de noviembre 2011

   Declaración de la financiación
Este trabajo fue financiado por los Institutos Nacionales de Salud Grant RO1 AG025343.M.G. fue apoyado por hemo y la Sangre de Formación proteínas subvención T32-DK007233.

Coordenadas atómicas de los 20 de menor energía estructuras de LA45 han sido depositados en el Banco de Datosde Proteínas como 2lgp entrada.

ABSTRACTO
 
El receptor de las lipoproteínas de baja densidad (LDLR), el principal receptor de la absorción de colesterol, se une a ligandos a través de sus sietemódulos de LDL-A (AL). Se presenta la resonancia magnética nuclear (RMN) y ligando las medidas vinculantes para los módulos cuarto y quinto de la LDLR (LA45), los módulos críticos de ApoE vinculante,a pH fisiológico.

A diferencia de LA5 y todos los demás módulos de LDLR, LA4 tiene una afinidad de calcio muy débil, lo que probablemente juega un papel fundamental en la liberación de endosomalligando.

La estructura de la solución de RMN de cada módulo en el par LA45 sólo mostró diferencias menores en comparación con los dominios análogos en las estructuras de cristal previamentedeterminado.
El enlazador de 12 residuos de conexión de los módulos, aunque ligeramente estructurado a través de una interacción con LA4, es muy flexible.

Aunque no intermódulos nuclear Overhauser sedetectaron efectos, las perturbaciones químicas cambio y la dinámica de columna vertebral sugieren interferencias entre los dos módulos.

La afinidad ligando de ambos módulos es mayor cuando los...
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