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Practica 1 Genómica Funcional
Alineamiento múltiple de proteínas
Grupo de Proteasas y Lipasas
Grupo B. Lipasas (tienen un solo dominio)
1) Grado de variabilidad de proteínas de lipasas en hongos.2) Lipasas representativas de cada grupo (generales).
3) Alineamientos con diferentes grupos de lipasas de hongos.
4) Reporte
1. Objetivo.
2. Descripción breve de la metodología.
3.Resultados: tabla de los organismos – ID de secuencia – Base datos. Árbol filogenético de ClustalW. Describir la interpretación del árbol.
4. Incluir un control.
Próximo viernes.
Buscar en basesde secuencias referencia.

Cambios en la actividad del genoma
Respuesta celular a señales externas.
Cambios transitorios en la actividad del genoma; dependientes a estimulos externos de pH,disponibilidad de agua, temperatura, nutrientes, captación de luz, etc.
Los estimulos externos en mamíferos superiores tienen que ver con hormonas, recpecion de nutrientes, entre otras.
Hay dos formas deefecto en la actividad genómica:
* Directo, cuando el compuesto que ejerce el estimulo es introducido a la celula y en esta se da el efecto
* Indirecto, el estimulo provoca un cambio en unreceptor o una proteína de membrana, la pared y este receptor ocasiona el efecto en la celula.
La transducción de señales ha sido de principal estudio debido a que la actividad bioquímica anormal deesta esta relacionada con cáncer.
1) SI el complejo es una proteína puede actuar activando o reprimiendo el complejo de iniciación de la transcropcion (12 animoacidos) o activador o silenciador desplicing
2) El compuesto senal puede influenciar la actividad de un factor proteico existente. Puede ser cualquier compuesto (hormonas, luz)
3) El factor puede influenciar a otros factoresproteicos mediante el uso de factores intermediarios (feromonas, nutrientes, pH) Multicomponentes.
Ejemplos.
Lactoferrina. Activador de la transcripción directo. La cual se une al hierro y al parecer...
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