Comparación De Dos Secuencias
Páginas: 2 (472 palabras)
Publicado: 28 de noviembre de 2012
Capítulo 8 Bioinformatics for Dummies
Comparación de dos secuencias
DIAGRAMAS DE PUNTO
• Proporcionan un método sencillo y de gran alcance para el análisis de
secuencias. • Su objetivo: -Identificar regiones de semejanza dentro de una sola molécula (repeticiones) o entre diversas moléculas. - Identificar secuencias con potencial para formar estructura secundaria por apareamiento debases.
Alineamiento de secuencias en bioinformática: Forma de representar y comparar dos o más secuencias o cadenas de ADN, ARN o estructuras primarias proteicas; permite resaltar sus zonas desimilitud, que podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas entre los genes o proteínas consultados.
Diagramas de puntos
Rango
DOTLET y su utilidad
•Regiones de similitud entre dossecuencias y regiones repetidas
dentro de una misma secuencia. •Es una herramienta muy práctica. •Se realizan gráficos de puntos. •Software gratuito, fácil de usar, no necesita instalación y puedeejecutarse en cualquier computadora con acceso a internet. •Actualmente sirve para construir comparaciones por pares.
Ventajas y desventajas de DOTLET
VENTAJAS
• Es muy fácil de usar y gratuito. • Es unprograma basado en Internet que se ejecuta en cualquier computadora con acceso a internet. • Es un applet de Java lo que significa que todo lo hace en su propia computadora en línea. • Es seguro deusar • Puede comparar secuencias de ADN, ARN y proteínas.
DESVENTAJAS • Se necesita experiencia para interpretar los resultados • Se requiere aprender a ajustar para producir un diagrama de puntosinformativos • No puede trabajar con secuencias largas (más de 10,000 aminoácidos o nucleótidos). • La velocidad del programa depende de la PC local • Cuanto más rápido el equipo, mas rápido elsistema. • Las diferencias se manifiestan con secuencias de más de 1000 residuos.
Programa y pantallas de información
DNADOT
• Con este programa se puede utilizar un rango más amplio
(100,000...
Comparación de dos secuencias
DIAGRAMAS DE PUNTO
• Proporcionan un método sencillo y de gran alcance para el análisis de
secuencias. • Su objetivo: -Identificar regiones de semejanza dentro de una sola molécula (repeticiones) o entre diversas moléculas. - Identificar secuencias con potencial para formar estructura secundaria por apareamiento debases.
Alineamiento de secuencias en bioinformática: Forma de representar y comparar dos o más secuencias o cadenas de ADN, ARN o estructuras primarias proteicas; permite resaltar sus zonas desimilitud, que podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas entre los genes o proteínas consultados.
Diagramas de puntos
Rango
DOTLET y su utilidad
•Regiones de similitud entre dossecuencias y regiones repetidas
dentro de una misma secuencia. •Es una herramienta muy práctica. •Se realizan gráficos de puntos. •Software gratuito, fácil de usar, no necesita instalación y puedeejecutarse en cualquier computadora con acceso a internet. •Actualmente sirve para construir comparaciones por pares.
Ventajas y desventajas de DOTLET
VENTAJAS
• Es muy fácil de usar y gratuito. • Es unprograma basado en Internet que se ejecuta en cualquier computadora con acceso a internet. • Es un applet de Java lo que significa que todo lo hace en su propia computadora en línea. • Es seguro deusar • Puede comparar secuencias de ADN, ARN y proteínas.
DESVENTAJAS • Se necesita experiencia para interpretar los resultados • Se requiere aprender a ajustar para producir un diagrama de puntosinformativos • No puede trabajar con secuencias largas (más de 10,000 aminoácidos o nucleótidos). • La velocidad del programa depende de la PC local • Cuanto más rápido el equipo, mas rápido elsistema. • Las diferencias se manifiestan con secuencias de más de 1000 residuos.
Programa y pantallas de información
DNADOT
• Con este programa se puede utilizar un rango más amplio
(100,000...
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