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Comparación de dos muestras
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Objetivo 
Realizar una comparación estadística con base en dos muestras, las cuales son comparadas a fin de obtener una inferencia sobre la población.
Nota: Las muestras a comparar no posee la restricción de que sean del mismo tamaño, de forma que puede tratarse de una muestra de 20 elementos contra otra de 25.La única limitante es que las muestras hayan sido originadas de información aleatoria.
Cuando emplearlo.
Esta metodología es empleada cuando se posee dos muestras de valores cuantitativos. Asimismo, se empleaúnicamente cuando ambas muestras se comparan con base en una sola variable, por ejemplo pesos de dos muestras de vasijas (una sola variable: peso), extensión de sitios de dos estilosarquitectónicos; no es valido cuando se comparan mas de una variable: comparación de estilos de unas vasijas por periodo, en la cual hay dos variables, periodo y estilo.

Porque comparar
De manera inicial, el proceso de comparar dos muestras generalmente es para determinar que dichas muestras poseen características distintas, por ejemplo un par de muestras de huesos de pavos, los cuales se comparanpara comprobar que ambas muestras provienen de distintas especies: pavo tipo 1 y pavo tipo 2. De manera general, se emplea dicha comparación para verificar que las muestras son iguales, o el caso contrario que proceden de poblaciones distintas.  

Marco Teórico
Diferencias entre poblaciones 
Cuando se toman dos muestras de una población, existe siempre cierta variación aleatoria que hace que susmedias varíen. Cuando hay dos muestras de dos poblaciones diferentes, parte de la variación entre las muestras es debida a esa variación aleatoria y parte de la variación viene del hecho de que las poblaciones pueden tener medias y dispersiones diferentes. 
Al comparar dos muestras, entonces, queremos saber si el contraste que vemos puede o no haber sido producido simplemente por variacionesaleatorias, para saber así si existen probabilidades de que las dos poblaciones son tan diferentes como las muestras reflejan.
Para el ejemplo de los sitios mayas visto en clase, quisiéramos, además de comparar las medias, estimar la probabilidad de que la la altura de los tableros de Oxkintok en realidad tenga la misma media que la altura de los tableros de Chichen Itzá. Es decir, queremos estimarla confianza en los estimativos de las medias.
Otra forma de tratar el mismo problema es estimar la probabilidad opuesta, o sea, ¿Qué probabilidad existe que las diferencias entre medias sean sólo causadas por errores del muestreo? Es decir, podemos estimar lasignificancia de la diferencia observada.
Nota: Recuerde que significancia y confianza son conceptos inversos: La confianza es laprobabilidad de estar en lo correcto, la significancia es la probabilidad de estar equivocado.
Para estos estimativos, se considera cada muestra por separado y las poblaciones probables de donde cada una de ellas viene (estimando rangos de error) y se comparan las medias y los rangos de error de esas medias para estimar probabilidades. 
Una forma gráfica de mostrar las probabilidades asociadas a lasmedias de cada muestra es en forma de Gráficos de bala.
Gráficos de bala (Bullet graphs) 
Los gráficos de bala permiten comparar muestras con diferentes rangos de error a varios niveles de confianza al mismo tiempo (usualmente 80%, 95% y 99%). 
Para obtener gráficos de bala, primero que todo se dibujan líneas horizontales que representan las medias de cada muestra. A cada media se le asociaentonces un determinado rango de error por encima y debajo de la media, para cada nivel de confianza, calculando los rangos en la forma usual. Los rangos de error se representan como barras. Como para distintos niveles de confianza, si la precisión es menor, el rango de error es más grande, entonces representamos la precisión con el ancho de la barra y el rango de error con su altura.
Muestras...