Metodo Deteccion Bacterias Patogenas Tracto Respiratorio

UNIVERSIDAD DE ANTOFAGASTA FACULTAD DE RECURSOS DEL MARDepartamento de Ingenieria en Acuicultura licenciatura En BIOTECNOLOGÍATecnologia de ARN BT - 721 |
“Diagnostico Molecular por q-RT-PCR-Múltiplexpara la Detección de Bacterias Patógenas del Sistema Respiratorio Humano.” |
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Dr. Mario Esparza Mantilla |
Daniel Chacana; Carlos Cortés; Diego Cornejo |
2 de Julio del 2010 |

En la actualidad el diagnostico etiológico de las enfermedades respiratorias sigue siendo un problema solo parcialmente resuelto ya que hasta ahora los métodos de diagnostico utilizados en clínica no presentanelementos característicos, y efectivos. Las enfermedades respiratorias son la tercera causa de muerte en Chile. Los recursos económicos destinados al diagnostico de las enfermedades respiratorias aumenta anualmente, y tamaño en cuenta que la mayoría de los análisis no son concluyentes, o toman un tiempo prolongado; es por esto que se requiere de un método de diagnostico efectivo en la detección depatógenos respiratorios, permitiendo su pronta identificación, disminuyendo la tasa de muertes y disminuir el uso de antibióticos inespecíficos. La utilización de técnicas moleculares ha sido ampliamente utilizada para la detección de patógenos asociados a ciertas enfermedades a través de genes marcadores de patogenicidad y/o resistencia a antibióticos. En este trabajo se propone un método dediagnostico molecular por qRT-PCR múltiplex, para la detección de ciertos genes específicos asociados a los mecanismos de patogenicidad de los patógenos respiratorios, utilizando diversas herramientas bioinformáticas en la elaboración de los mismos. De esta manera se espera obtener un sistema de diagnostico que complemente a los actualmente utilizados en el servicio nacional de salud de Chile. |Introducción

El diagnóstico de los patógenos respiratorios continúa siendo un problema sólo parcialmente resuelto, ya que ni la clínica ni la radiología ni la serología presentan elementos característicos, y efectivos, que permitan presumir un origen viral, bacteriano o mixto (1).

Las enfermedades respiratorias pueden ser causadas por distintos patógenos como lo son bacterias, virus, hongos oparásitos. Estas enfermedades son muy frecuentes, donde la frecuencia relativa de cada patógeno varía de acuerdo a factores tales como la edad del paciente, la existencia de enfermedades asociadas y el contexto en que se adquiere la infección, entre otros. Así mismo estos factores influyen en la clínica, la radiología, la selección del tratamiento, la evolución, las complicaciones y el pronóstico dela enfermedad. Se caracteriza por fiebre, sintomatología respiratoria variable y la aparición de infiltrados pulmonares. Todos los patógenos respiratorios presentan una sintomatología similar por lo que los métodos de diagnostico como los clínicos, radiológicos y evolutivos, distan mucho de ser completamente eficaces en cuanto a la detección de los mismos (2).

Entre un 30-50% de lasenfermedades respiratorias adquiridas en la comunidad persisten sin diagnóstico etiológico incluso cuando se efectúa esfuerzos en utilizar medios de cultivos adecuados e implementación de extensos protocolos serológicos. Esto es especialmente importante en neumonía neumocócica, en las que algunos estudios informan hasta un 45% de cultivos de negativos. (Patricia García Cañete, 1999, Anexo Tabla 4).

Elmétodo que se propone en el presente informe, innova en reducir el tiempo necesario para diagnosticar, el costo de los reactivos involucrados, también involucra técnicas de genómica y bioinformática actuales y que reducen en forma drástica las incertidumbres sobre los patógenos a identificar, ya que se utilizan marcadores específicos para cada patógeno. Este nuevo método tiene como finalidad poder...