Reflexión sobre el concepto de especie bacteriana

1

Klebsiella variicola: reflexión sobre el concepto de especie bacteriana

Mónica Rosenblueth, Lucía Martínez1 y Esperanza Martínez-Romero
Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno, UNAM. Apdo. postal 565-A. Cuernavaca, Mor. emartine@cifn.unam.mx. Centro de Inv. en Ciencias Médicas y Biológicas. Facultad de Medicina y Cirugía. Universidad Autónoma "Benito Juárez" de Oaxaca.Ex-Hacienda de Aguilera s/n Carretera a San Felipe del Agua. Oaxaca, Oaxaca, CP 68020
1

¿Especies en bacteria?

Mucho se ha debatido lo que significa una especie bacteriana. Los conceptos más aceptados son el de coherencia y el evolutivo (39). Estos implican que los miembros de una especie tienen una historia evolutiva común y recombinación entre los mismos que mantiene su coherencia genética. Laespeciación se da con el aislamiento genético o geográfico de poblaciones en periodos de tiempo que permiten acumular diferencias en las secuencias de sus genes y funcionalidad. La transferencia genética lateral puede ocasionar cambios tan drásticos con consecuencias importantes de adaptación a nuevos nichos que se ha considerado como un mecanismo de especiación instantáneo, como en el caso deYersinia pestis, aunque se ha discutido que esta especie es una clona de Y. pseudotuberculosis (33). En ocasiones es difícil

2

distinguir especies cercanamente relacionadas y seguramente existen grupos bacterianos que se encuentran en proceso de especiación (34). Sobre la existencia y el significado de las especies en bacterias se han escrito numerosas revisiones (10, 11, 40, 33, 48). Enalguna de ellas se revisan más de 20 conceptos diferentes de especie (39). Operativamente las especies se reconocen por sus características genéticas y fenotípicas particulares (55). Sin embargo, es cada vez más claro que las características fenotípicas cambian con facilidad. Grupos genéticamente distantes pueden coincidir fenotípicamente y grupos con parecidos fenotípicos pueden diferirsignificativamente a nivel genético. Las secuencias del genoma común entre miembros de una especie representarían la esencia de la especie. De manera un poco burda y con resultados difíciles de interpretar, la hibridación ADN-ADN refleja la conservación de secuencias entre bacterias y se ha considerado como la regla de oro para definir especies (52). Más finamente, las secuencias de nucleótidos de una muestrarepresentativa de los genes de una población bacteriana constituyen el fundamento para reconocer y definir especies. Actualmente se ha propuesto que 5 genes serían suficientes para describir las especies (51) cuando anteriormente se consideraba que la secuencia del gen ribosomal 16S era suficiente (18). Ciertamente estamos en la era de los marcadores filogenéticos (que reflejan las relaciones deorigen) en vez de los marcadores fenotípicos de la sistemática bacteriana clásica. Las metodologías para reconstruir filogenias a partir de secuencias han avanzado de manera sustancial y permiten reconocer eventos de recombinación (6, 35), además de sugerir mecanismos y caminos evolutivos en las poblaciones bacterianas (1, 36).

Klebsiella

3

En 1985 Trevisan nombró el género Klebsiella enhonor del microbiólogo alemán Edwin Klebs y describió la especie Klebsiella pneumoniae en 1887. En ese momento también se designó a K. rhinoscleromatis (actualmente una subespecie de K. pneumoniae) que había sido aislada en 1881 de las fosas nasales de un paciente (20). La especie más cercana a K. pneumoniae, K. variicola la nombramos 116 años después de aquella (47) y en este capítulo se presentanlos antecedentes y bases para proponer esta nueva especie. Históricamente, las especies de Klebsiella, como las de muchas otras bacterias, se establecieron basándose en su patología o en su origen. Debido a esto, ha prevalecido una gran confusión en su nomenclatura con propuestas de bacterias nuevas, sinónimas de otras ya propuestas (20, 24, 46). Las especies que se cuentan en el género...