Reporte Pratica Medicion Angulos Y Distancias
Facultad de Ciencias Quimicas
Trabajo:
Practica 2
Asignatura:Quimica Computacional
A 15 de Febrero del 2013
PRÁCTICA 2.
CONSTRUCCIÓN DE LA MATRIZ Z
Objetivos
▪ Construye la matriz Z paradiferentes moléculas.
Trabajo de Pre-Laboratorio
1. ¿Qué se conoce como matriz Z?
-Representa una matriz con coordenadas, en donde se establece la posicion de cada atomo al hacer lamolecula.
2. ¿Para qué sirve la construcción de la matriz Z en un programa de cálculo de química computacional?
- En mi opinion, sirve para facilitar las cosas, claro, si esque se hace buen usode ella, ya que modificando una plantilla establecida, se puede crear cualquier tipo de molecula deseada.
Introducción
En esta modalidad de introducir las posiciones de los núcleos, si tenemos Nátomos, se usan N-1 distancias de enlace, N-2 ángulos de enlace y N-3 ángulos de torsión.
En ellas se siguen una serie de pasos:
• Se ordenan los núcleos: 1,2,..., N.
• Se indica ladistancia entre el 1 y el 2 [pic], que es la que define el eje Z.
• Para el tercer átomo, se definen las magnitudes [pic]y [pic], es decir la distancia a uno de los anteriores y el ángulo que forman, conlo que definimos el plano XZ y consecuentemente el sistema de coordenadas completo.
• Para los siguientes átomos k, se indica la distancia [pic], el ángulo [pic]y aquí tenemos dos opciones,o indicar el ángulo de torsión respecto al plano formado con otro átomo m [pic];
o indicar otro ángulo con otro átomo [pic], sin embargo en esta opción suelen existir dos posibilidadesque hay que concretar, si el átomo k esta por encima o por debajo del plano formado por los átomos i,j,m (+1 ó -1 respectivamente).
Nota: Los átomos mudos se suelen indicar con el símbolo X,...
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