Tecnicas moleculares

Rev Chil Infect (2003); 20 (1): 26-38

INFECTOLOGÍA AL DÍA

Biología molecular en Infectología. Parte II: Diagnóstico molecular de agentes infecciosos
ALEJANDRO CORVALÁN R.1,2, FRANCISCO AGUAYO G.1,3, JORGE LÉVICAN G.1 e IGNACIO CORVALÁN V.1

Molecular biology in infectious diseases - Part II: Molecular diagnosis of infectious agents
The diagnostic applications of the molecular biology ininfectious diseases are wide and applicable to any diagnostic problem. In the Herpesviridae family, the most used methods are those based on the amplification of DNA polymerase gene for the detection of HSV 1 and 2, varicela-zoster, citomegalovirus, Epstein Barr virus and HHV6 simultaneously. This methodology has been able of detect the coinfection of HSV1 and VZV in samples of CNS fluid. Incitomegalovirus, molecular methods are used in the monitoring of the reactivation of CMV in immunosuppressed patients and are able to detect viral reactivation within 1 week before symptoms. The molecular methods are also able to identify the Epstein-Barr virus in a proportion of 8 to 20% of gastric cancer cases harboring a unique strain in spite of the presence multiples strains in the healthypopulation. These associations between virus and cancer have also been described for the human papilloma virus and esophageal and lung cancer. In bacterial agents, the detection and quantification of Bordetella pertussis is another interesting application since it might become a method for rapid diagnosis and predictive of severity in children less than 6 months old. The identification of Helicobacterpylori strains in relation to gastric cancer and peptic ulcer disease and the characterization of strains of methicillin resistant Staphylococcus aureus are other examples of potential applications of the molecular methods in typing microorganisms. In the diagnosis of respiratory tract infectious agents such as Mycobacterium tuberculosis, Pneumocystis carinii and atypical agents, the molecularmethods allow the diagnosis in non-invasive samples. Finally, these new methodologies also contribute to the diagnosis of systemic mycotic agents (Candidiasis and Aspergillosis) particularly in immunosuppressed patients. Key words: Infectious disease; Molecular biology; Molecular diagnosis. Introducción Las aplicaciones diagnósticas de la biología molecular son extremadamente variadas y básicamenteson aplicables a cualquier problema diagnóstico asociado a procesos biológicos. Actualmente las principales aplicaciones están en enfermedades infecciosas, oncológicas y genéticas. En enfermedades infecciosas algunas de las principales aplicaciones diagnósticas se entregan en
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la Tabla 1. Esta tabla muestra una visión panorámica de usos de la biología molecular, algunas de las cuales seencuentran implementadas en nuestro país y describiremos a continuación. Virus herpes simplex Los virus herpes simplex (VHS) tipo 1 y tipo 2 pertenecen a la familia Herpesviridae, y poseen ADN de doble hebra como material genético. Los

Laboratorio de Biología Molecular Clínica Las Condes. Instituto Chileno Japonés de Enfermedades Digestivas Hospital Clínico San Borja Arriarán. Laboratorio deBiología Molecular Hospital del Tórax.

Recibido: 31 enero 2003 Aceptado: 31 enero 2003 (Primera parte publicado en el N° 1 Vol 19, año 2002).

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Biología molecular en Infectología II - A. Corvalán R. et al.

son las utilizadas para la amplificación por RPC con partidores de consenso y las regiones de baja homología permiten la idenMicroorganismo Metodología Laboratorio tificación de cadavirus de la faVirus milia Herpesviridae a través de sonCitomegalovirus RPC CA, CLC, PUC das específicas. Esta metodología branched DNA se ha implementado como kit cosecuenciación mercial (Pharmagen®) y ha sido Enterovirus RT-PCR CLC, CA, PUC utilizada en el Centro de DiagnósVirus de Epstein-Barr RPC CLC, HT tico Molecular de BIOS Chile Virus de hepatitis C branched DNA HCUCH IGSA. Con ella se han...