Aminoacidos Y Proteinas

PROBLEMAS
1. En la fórmula del siguiente aminoácido (aa) indique los grupos carboxilo, amino y el radical ( -R ).
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2. Un criterio para clasificar los aminoácidos permite establecer tres grupos: neutros, ácidos y básicos. Abajo aparecen las fórmulas de aminoácidos que pertenecen a las 3 diferentes categorías.
a. Reconozca a los aminoácidos neutros, ácidos y básicos. ¿Quécaracterística le permitió identificarlos?
b. Identifique aminoácidos neutros azufrados, alcohólicos, aromáticos y alifáticos.
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3. Otro criterio de clasificación de los aminoácidos atiende a la polaridad del grupo -R. El carácter polar o apolar de los grupos -R es clave en los arreglos espaciales de las proteínas. Identifique entre los aminoácidos de la pregunta 2 los que presentan -R polar concarga negativa, -R polar con carga positiva, -R polar sin carga y - R apolar.
|Un grupo -R polar es hidrofílico. La polaridad se debe a la presencia de carga positiva o negativa de un -R|
|ionizado (caso de AA polares con carga), o a cargas parciales de enlaces dipolo permanentes que tenga el -R|
|no ionizable (caso de AA polares sin carga). Los grupos -R apolares son hidrofóbicos, por tenermuchos |
|enlaces C-C y C-H. |


4. Especifique el (los ) aminoácido (s) cuya cadena lateral (-R) tiene las siguientes características:
a. Esta cargado positivamente a pH neutro
b. Tiene un grupo funcional alcohol ( o fenólico)
c. Contiene un tiol
d. Tiene carácter aromático
e. Contieneun grupo funcional amida
f. Puede participar en enlaces por puente de hidrógeno
g. Contiene cuatro carbonos en su grupo R
5. Enliste los aminoácidos que exhiben las siguientes características:
a. Esta cargado positivamente a PH de 7
b. Esta cargado negativamente a pH de 7
c. Puede formar enlaces disulfuro
d. No es quiral
e. Tiene mas de un carbono quiral
4. ¿Cualesaminoácidos son capaces de formar enlaces por puentes de hidrógeno? ¿Cuales podrían promover interacciones hidrofóbicas? ¿qué aminoácidos cumplen con ambas categorías ?
5. La capacidad de algunos aminoácidos para absorber la luz ultavioleta se traduce en una técnica para la detección de todas las proteínas ¿por qué si o por que no?
4. a. A partir del aminoácido que aparece abajo en su forma nodisociada formule el dipolo.
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b. ¿Cómo se comporta el grupo carboxilo y el grupo amino según la tendencia a ceder y ganar protones?
5. Según el pH de la solución, el aminoácido puede estar como dipolo, ión positivo o ión negativo.
a. Formule el aminoácido en sus distintas formas iónicas a partir del dipolo representado abajo. Observe que el pH del medio define la forma en que seencuentra el aminoácido.
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b. ¿Cómo se llama el valor de pH en el cual un aminoácido se encuentra 100% como dipolo?
6. Si un compuesto con carga (ión) se somete a un campo eléctrico las moléculas se moverán hacia el polo contrario a su carga. En este principio se basa una técnica ampliamente usada en estudios bioquímicos y genéticos: la electroforesis.
a. Haga un esquema de un equipo deelectroforesis y reconozca la fuente de poder, la cuba, los electrodos y el soporte de la corrida.
b. ¿Hacia dónde migrará el aminoácido alanina en las tres situaciones de pH presentadas en la pregunta 5.a.
8. Tres aminoácidos, gly(g) , ser(S) y trp(W), reaccionan para producir un tripéptido. Indique todos los posibles productos en la reacción. Especifíque los residuos amino y carboxiloterminal en los productos.
Nota. Estos tres valores de pH corresponden a tres valores de pKa para el ácido aspártico. Existen diferentes pares ácido – base conjugados en cada uno de estos puntos.

11. La electroforesis puede ser usada para separar moléculas de diferente carga. Un campo eléctrico puede ser generado { (+) -------- (-) } en una matriz de material estacionario. Si los aminoácidos...