Análisis del artículo: “a three-species model explaining cyclic dominance of pacific salmon”

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  • Publicado : 16 de diciembre de 2011
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Análisis del artículo "The challenges and scope of theoretical biology"
INTRODUCCIÓN
La construcción de modelos ha demostrado ser un gran éxito cuando se trata de explicar y predecir el comportamiento de ciertos sistemas biológicos. En este trabajo se exploran las teorías generales de la biología, y sugieren que éstas no sólo se inspiran en la física, sino también de las ciencias de lainformación. La biología teórica futura es probable que represente un híbrido de razonamiento y explicación parsimoniosa algorítmica o basada en reglas. Una pregunta abierta es si estos nuevos marcos seguirán siendo transparentes a la razón humana. En este contexto, se discute el papel de la máquina de aprendizaje en las primeras etapas del descubrimiento científico. Se argumenta que la historia evolutivano sólo es una fuente de incertidumbre, sino que también proporciona la base, a través de los rasgos conservados, por explicaciones muy generales de regularidades biológicas, y la perspectiva de las teorías unificadas de la vida.

CONCLUSIONES
Los niveles más altos no captan toda la variación presente en los niveles más bajos. La variación crítica en los niveles más bajos, sin embargo, puedepromover a través de los accidentes de congelados, la diversidad en los niveles más altos de un tipo que impide que una teoría de alcanzar el carácter universal de las leyes físicas. Esperamos que este sea el caso de las teorías biológicas, en gran parte como resultado de la función permanente de las condiciones iniciales que se propaga a través de los procesos evolutivos. Las teorías predictivasque muestran importantes grados de generalidad de la biología han tendido a basarse en las propiedades dinámicas de los sistemas biológicos o derivados de un cálculo lógico como parsimonia y sus extensiones estadísticas. Los ejemplos que se citan en el artículo (escala, algoritmos genéticos y redes neuronales) ilustran que el objetivo de ambas teorías y modelos es proporcionar los marcos de launificación de las cantidades medibles, capaces de generar estados explicativo y predictivo sobre la naturaleza. Estos modelos también ponen de manifiesto un cambio de perspectiva - desde sistemas de parsimoniosos de las relaciones entre las variables macroscópicas (escala), a las especificaciones, de algoritmos, más detalladas; la generación de patrones de comportamiento a nivel microscópico(regulación de genes y los nervios) Los modelos representan la aplicación dominante de las matemáticas y la computación en la biología. La teoría ideal sería apoyar un gran número de modelos diferentes y el marco de una amplia gama de contextos diferentes. El más fundamental de la teoría, cuanto mayor es su generalidad La encarnación más reciente del enfoque basado en modelos para la biología es labiología de sistemas, cuyo objetivo es automatizar, en la medida de lo posible, el análisis y la reducción de grandes masas de - más recientemente moleculares - los

datos, y presentarlos en términos de datos de parsimoniosas estructuras.Estas estructuras tienden a ser seleccionadas sobre la bases de cálculo, de la eficiencia y generalidad. Sin embargo, en la biología de sistemas también ha habido unesfuerzo por conciliar estas estructuras con el mecanismo conocido a través de la simulación y los enfoques basados en reglas con el fin de proporcionar una base para el análisis sistemático de la lógica y la dinámica de procesos biológicos. Así, los modelos se pueden derivar de una teoría general - de arriba hacia abajo - a través de la aplicación de las restricciones, o que se derivan de losdatos - de abajo hacia arriba - a través de la asunción de las estructuras de datos que prefiera. En ambos casos, el modelo representa una estructura de servicio público local cognitivas y predictivo. La teoría proporciona la base para la síntesis general de los modelos, y un medio de apoyo a las comparaciones de modelos y idealmente se establece el modelo de equivalencia. Un énfasis en los...
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