Cromatina Bacteriana

Cromatina bacteriana

Estudios recientes han revelado que el nucleoide bacteriano es una entidad dinámica que altera su estructura general en respuesta a cambios en la tasa de crecimiento y la fase de crecimiento tanto. Estos cambios estructurales se correlaciona con, y puede ser impulsado por, los cambios en la distribución y utilización de superenrollamiento del ADN. A su vez, estosparámetros además de la delimitación de dominios topológicos dependen tanto de las proporciones relativas de los abundantes nucleoid proteínas asociadas y sobre la actividad transcripcional. La estructura de dominio en sí es dinámica.

La dependencia de la abundancia de las proteínas asociadas a nucleoide en fase de crecimiento se basa en el número calculado de moléculas por célula, según lo informado porAli Azam, ajustado por el promedio de número de cromosomas por célula. + / + + / + + + Indican diferentes grados de limitaciones de superhelicity negativo (por ejemplo, FIS limita sólo una densidad baja superhelical in vitro mientras que HU constriñe una densidad superhelical alta). Indica no conocido. Abreviaturas: HMGB, de alta movilidad grupo B; StpA, supresores de timidilato sintasa A.fenotipo mutante
 El macrodominio de la estructura de la E. coli nucleoide y su relación con la respuesta transcripcional a superenrollamiento. La extensión de los macro dominios asignadas (círculo interno) se toma del estudio realizado por Valente: verde, Ori macro domino, rojo, Ter macro dominio; macrodominio azules, asignadas otras regiones de puntos, mal definida estructura. Respuestas agrupadasa la relajación de súper helice negativo se indiquen fuera del mapa cromosómico: verde, reprimidos relajación de las transcripciones, rojos, activadas por la relajación de las transcripciones (adaptado de los estudios por Willenbrock y Ussery y Peter . Los grupos de FIS de sitios de unión para cerrar Ter se toman a partir del estudio por Ussery et al, y la región de alta actividadtranscripcional en células de rápida crecientes del estudio por Jeong et al
Alteraciones del crecimiento en fase dependientes de la organización del nucleoide. Las estructuras inferidas a partir de células de crecimiento exponencial (adaptado del trabajo de Cabrera y Jin indican que la organización de los bucles y los sitios de transcripción depende en gran medida de la tasa global de latranscripción. Estas estructuras de asumir una forma circular abierta, pero las estructuras interwound (para revisión, véase también son posibles. Las estructuras de la fase estacionaria se basan en la visualización por microscopía electrónica .En la fase estacionaria temprana, mostrar caminos interconectados tu toroidales de ADN, y en la fase estacionaria tardía que indican un enrejado de dúplex de ADN regularmenteespaciados (que se muestra en extremo)
Red Reguladora de las interacciones implicadas en la coordinación de super helice negativo, estructura de la cromatina y la transcripción. El efectivo, o disponible, super helice es detectada por la ARN polimerasa. Esta detección puede ser modulada por la polimerasa ppGpp efector y también por los adaptadores de la transcripción, incluyendo los factoressigma y la subunidad polimerasa ω. El total, o global, super helice depende tanto de restricción por abundantes proteínas de la cromatina, tales como HU y H-NS, y sobre la actividad de las topoisomerasas diferentes. A su vez, la expresión de las topoisomerasas se regula por 'monitor' proteínas, tales como FIS, la expresión de que en sí es muy fuertemente dependiente de superenrollamiento negativo.Transferencia genética y taxonomía bacteriana
La información genética de las bacterias ha desempeñado un pequeño papel hasta ahora en la sistemática bacteriana. Con el uso cada vez mayor de bacterias como sujetos de experimento genético, la información que se dispone en la última década, pero una gran parte de ella es fragmentaria y dispersa a través de la literatura en los papeles que no...