Estudio genetico de la dorada a partir de mapas genéticos y de ligamiento

1. INTRODUCCIÓN

Los peces de aleta radiada (actinopterigios) constituyen un grupo taxonómico muy diverso que comprende a los peces teleósteos, cuyos estudios morfológicos, comportamentales y ecológicos han supuesto aportaciones muy importantes en el estudio de cuestiones evolutivas. Si bien muchos de estos presentan elevado interés comercial por su importancia económica, en la pesca y laacuicultura, ninguna de las especies consideradas económicamente interesantes han sido diana estudios genéticos que permitan obtener información para mejorar la explotación de estos recursos, debido a las dificultades que suponen su reproducción y cría. Por ello en los últimos años los estudios se han dirigido principalmente a desarrollar herramientas que permitan detectar genes candidatos oregiones que determinen rasgos cuantitativos (QTLs).

Ejemplo de ello es la dorada (Sparus aurata). Pez teleósteo marino que se encuentra en aguas templadas y tropicales, predominando en el noreste del océano Atlántico y en el mar Mediterráneo, representa un elemento clave para el ecosistema marino, y es una de las especies de mayor interés comercial. Por todo ello se han desarrollado estudios connuevas herramientas genómicas que han permitido que la dorada sea uno de los teleósteos mejor caracterizados: Sarropoulou et al. realizaron un microarray de DNA de segunda generación de esta especie, Senger et al. construyeron un mapa RH preliminar, Franch et al. desarrollaron el primer mapa de ligamiento. Además está en desarrollo el proyecto de secuenciación del genoma de la dorada y laconstrucción de mapas RH mejorados (FRANCH). Junto con el desarrollo y aplicación de herramientas genómicas podrían crearse vínculos con organismos modelo de otras especies, dando a S. aurata esta categoría, y extender los conocimientos a otras especies de interés.

Si bien la aplicación de la genética molecular para la selección de los peces en la acuicultura es aún incipiente, las técnicas demapas de ligamiento o mapeo por RH que se describen en este trabajo suponen un marco sólido para la aplicación del análisis de QTL y la selección asistida por marcadores de rasgos importantes, especialmente las que son difíciles de medir y / o tienen baja heredabilidad.

Los mapas de ligamiento son una herramienta crítica en estudios genéticos de poblaciones: determinar ubicaciones de genesasí como la cercanía o xistencia de ligamiento entre estos, incluso identificar loci genéticos implicados en fenómenos biológicos (adaptación a la temperatura del agua o la salinidad, el estrés y resistencia a enfermedades, el momento para el cambio de sexo), distinguir funciones y ubicarles en el genoma. Sin embargo los mapas de radiación híbrida han demostrado ser una herramienta más valiosa yde gran alcance para producir mapas del genoma, densos y fiables. Esta tecnología provee recursos para estudios genéticos y el análisis comparativo del genoma, ayuda de montaje de las secuencias shotgun, y permite extraer información útil para la comparación y el análisis del genoma. En contraste con los mapas de ligamiento genético, permite el mapeo de los marcadores moleculares no polimórficoscomo TER o genes.

Se basa en un método estadístico para determinar no sólo las distancias entre el ácido desoxirribonucleico (ADN) y los marcadores, sino también su orden en los cromosomas. Para ello se crean células híbridas del organismo de interés y una línea celular. Antes el genoma de interés es irradiado, de manera que se rompe  y posteriormente se integran los trozos en loscromosomas de los roedores. Las únicas células que pueden sobrevivir el procedimiento son híbridos entre donantes y receptores que han adquirido un gen para la enzima de roedores esenciales de la línea de células irradiadas roedores humanos. A partir de estos híbridos, pueden aislarse los clones, y analizar la presencia de marcadores de ADN así como la fuerza de retención en cada clon.

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