Procedimientos en microbiología clínica

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rocedimientos en Microbiología Clínica
Recomendaciones de la Sociedad Española de Enfermedades
Infecciosas y Microbiología Clínica

1a. RECOGIDA, TRANSPORTE Y PROCESAMIENTO GENERAL DE LAS MUESTRAS EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA 2003 |
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DOCUMENTO CIENTÍFICO1. INTRODUCCIÓNLa actividad que desarrolla el laboratorio de microbiología está orientada esencialmente al diagnósticomicrobiológico de las enfermedades infecciosas. Una parte importante de esa actividad consiste en el aislamiento, la identificación y la determinación de la sensibilidad a los antimicrobianos de los microorganismos causales de estas enfermedades. Otra parte importante de la actividad de un laboratorio de microbiología consiste en la detección de anticuerpos, antígenos y ácidos nucleicos en diversasmuestras (sangre, líquidos estériles, orina, etc.), técnicas que resultan muy útiles en el diagnóstico precoz de determinadas enfermedades infecciosas. La gran diversidad de muestras clínicas y de métodos diagnósticos aplicables, son dos aspectos que diferencian el laboratorio de microbiología de otros laboratorios clínicos. Este documento pretende exponer de forma resumida los aspectos referentes ala recogida, transporte y procesamiento de las muestras que son relevantes para que la actividad del laboratorio de microbiología se desarrolle de manera eficaz y eficiente. Los aspectos relacionados con las pruebas rápidas de detección de anticuerpos, antígenos y ácidos nucleicos no se describen en el presente procedimiento y serán desarrollados en otros posteriores.2. CONSIDERACIONES CLÍNICASElprimer paso del diagnóstico microbiológico comienza con la obtención de la muestra clínica adecuada. Para ello es preciso conocer los posibles agentes etiológicos de las enfermedades infecciosas y los mecanismos patogénicos de los mismos. La muestra debe ser representativa del proceso infeccioso que se pretende diagnosticar, teniendo siempre en cuenta que en determinadas infecciones, muestras norelacionadas directamente con la focalidad clínica, pueden tener también un buen rendimiento microbiológico. El síndrome clínico y los posibles agentes etiológicos implicados condicionan no sólo el tipo de muestra a enviar sino también su procedimiento de obtención y el transporte al laboratorio. En la tabla 1 se resumen los distintos tipos de muestras adecuadas en función de las infecciones máscomunes. Igualmente, la información clínica es la que permite al laboratorio aplicar las técnicas diagnósticas disponibles de manera más eficiente. Por ello es fundamental que el microbiólogo esté en estrecha comunicación con los clínicos y que participe activamente en el proceso diagnóstico del paciente. A su vez, el laboratorio de microbiología debe poner a disposición de los clínicos toda lainformación necesaria sobre las posibilidades diagnósticas que el laboratorio ofrece. Para ello, debe elaborar y distribuir la cartera de servicios disponible. Tabla 1.- Muestras clínicas recomendadas para el diagnóstico microbiológico de las infecciones más comunes Tipo de infección | Muestra | Comentarios |
Bacteriemia | Hemocultivos |   |
Infecciones cardiovasculares y asociadas a dispositivosintravasculares (IV) |
Endocarditis | Hemocultivos/Válvula/Verrugas | |
Infección del catéter | Catéter IV, piel pericatéter, conexión del catéter | |
Pericarditis | Líquido pericárdico | |
Sistema nervioso central |
Meningitis | LCR | |
Abscesos cerebrales | Aspirados de abscesos | |
Tracto respiratorio |
Faringoamigdalitis | Exudado faríngeo | |
Sinusitis | Aspiradosinusal | No válidos los exudados nasales |
Otitis media | Timpanocentesis | |
Otitis externa | Exudado oído externo | |
Neumonia | Esputo, muestras obtenidas por fibrobroncoscopia, punción transtorácica aspirativa, punción transtraqueal, broncoaspirado | |
Empiema y abscesos pulmonares | Líquido pleural, aspirados de abscesos | |
| Nasofaríngeo | Diagnóstico tosferina/Infecc. víricas...
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