Proteína Bioquímica

TRABAJO DE EVALUACIÓN CONTINUA CARM1 coactivator-associated arginine methyltransferase 1

Lourdes Patricia Román Cano Bioquímica-Biomoléculas

1º Biotecnología

1.-Información general sobre la proteína Nombre completo: Histone-arginine methyltransferase CARM1 Organismo en el que se encuentra: Mus musculus (ratón) Localización cromosómica: 19p13.2 Función: Las proteínas argininaN-metiltransferasas, tales como CARM1, catalizan la transferencia de un grupo metilo de la S-adenosil-L-metionina a los nitrógenos de la cadena lateral de los residuos de arginina, dentro de las proteínas para formar metilados derivados de arginina y S-adenosil-L homocisteína. La metilación de la arginina ha sido implicada en la transducción de señales, en el metabolismo del preARN, y en la activacióntranscripcional.

2.-Secuencia aminoacídia Aunque existen dos isoformas distintas de esta proteína (generadas por splicing alternativo), nos centraremos en la primera, que responde a la siguiente secuencia:
10 20 30 40 50 60

MAAAAATAVG PGAGSAGVAG PGGAGPCATV SVFPGARLLT IGDANGEIQR HAEQQALRLE 70 80 90 100 110 120

VRAGPDAAGI ALYSHEDVCV FKCSVSRETE CSRVGRQSFI ITLGCNSVLI QFATPHDFCS 130 140 150 160 170180

FYNILKTCRG HTLERSVFSE RTEESSAVQY FQFYGYLSQQ QNMMQDYVRT GTYQRAILQN 190 200 210 220 230 240

HTDFKDKIVL DVGCGSGILS FFAAQAGARK IYAVEASTMA QHAEVLVKSN NLTDRIVVIP 250 260 270 280 290 300

GKVEEVSLPE QVDIIISEPM GYMLFNERML ESYLHAKKYL KPSGNMFPTI GDVHLAPFTD 310 320 330 340 350 360

EQLYMEQFTK ANFWYQPSFH GVDLSALRGA AVDEYFRQPV VDTFDIRILM AKSVKYTVNF 370 380 390 400 410 420

LEAKEGDLHRIEIPFKFHML HSGLVHGLAF WFDVAFIGSI MTVWLSTAPT EPLTHWYQVR 430 440 450 460 470 480

CLFQSPLFAK AGDTLSGTCL LIANKRQSYD ISIVAQVDQT GSKSSNLLDL KNPFFRYTGT 490 500 510 520 530 540

TPSPPPGSHY TSPSENMWNT GSTYNLSSGV AVAGMPTAYD LSSVIAGGSS VGHNNLIPLA 550 560 570 580 590 600

NTGIVNHTHS RMGSIMSTGI VQGSSGAQGG GGSSSAHYAV NNQFTMGGPA ISMASPMSIP

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La proteína tiene una longitud de 608 aminoácidos, aunque eldominio arginina metiltransferasa comprende 346 residuos de estos aminoácidos. Comienza en el residuo 147, con una alanina (“A” indicada en rojo) y acaba en el residuo 477, con una tirosina (“Y” señalada en color azul). 3.-Secuencia nucleotídica
1 ggcctcggcc tgcgcggcgg cggcagcggc ggcggcggcg gcggcggcgg cctgggcccg 61 ggtgcggcgg tggcggtggc cgtggtggca gcggggcctg gagccggacc taagatggca 121 gcggcggcagcgacggcggt ggggccgggt gcggggagcg ctggggtggc gggcccgggc 181 ggcgcggggc cctgcgctac agtgtctgtg ttcccgggcg cccgcctcct cactatcggc 241 gacgcgaacg gcgagatcca gcggcacgcg gagcagcagg cgctgcgcct tgaggtgcgc 301 gccggaccag acgcggcggg catcgccctc tacagccatg aagatgtgtg tgttttcaag 361 tgctcggtgt cccgagagac agagtgcagt cgtgtgggca gacagtcctt catcatcacc 421 ctgggctgca acagcgtcct catccagttt gccacacccc acgatttctg ttctttctac481 aacatcctga aaacctgtcg gggccacaca ctggagcgct ctgtgttcag tgagcggaca 541 gaggaatcct cagctgtgca gtacttccag ttctatggct acctatccca gcagcagaac 601 atgatgcagg actatgtgcg gacaggcacc taccagcgtg cgatcctgca gaaccacacg 661 gacttcaagg acaagatcgt tctagatgtg ggctgtggct ctgggatcct gtcatttttt 721 gctgctcaag caggagccag gaaaatttat gcagtggaag ccagcaccat ggctcagcat 781 gcagaggtcc tggtgaagag taacaatctg acagaccgcatcgtggtcat ccctggcaaa 841 gtagaggagg tctcattgcc tgagcaagtg gacattatca tctcagagcc catgggctac 901 atgctcttca atgaacgaat gctcgagagc tacctccatg ccaaaaagta cctgaagcct 961 agtggaaaca tgttccccac cattggtgat gtccacctcg cacccttcac tgatgaacag 1021 ctctacatgg agcagttcac caaagccaac ttctggtacc agccatcctt ccatggagtg 1081 gacctgtcgg ccctcagagg cgccgctgtg gatgagtact tccggcaacc tgtggtggac 1141 acatttgaca tccggatcctgatggccaaa tctgtcaagt acacagtgaa cttcttagaa 1201 gccaaagaag gcgatttgca caggatagaa atcccattca aattccacat gctgcattca 1261 gggctagtcc atggcttggc cttctggttc gatgttgctt tcattggctc cataatgacc 1321 gtgtggctat ccacagcccc aacagagccc ctgacccact ggtaccaggt ccggtgcctc 1381 ttccagtcac cgttgtttgc caaggccggg gacacgctct cagggacatg tctgcttatt 1441 gccaacaaaa gacagagcta tgacatcagt attgtggcac aggtggacca gacaggctcc...