sintesis de peptidos

UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MÉXICO

INSTITUTO DE BIOTECN OLOGÍ A

MÉTODOS FÍSICO-QUÍMICOS EN BIOTECNOLOGÍA

Presenta:
Erandi Lira Navarrete

Coordinador del curso:
Dr. Roberto P. Stock Silberman

Cuernavaca, Morelos. Junio de 2007.

SÍNTESIS DE PÉPTIDOS

ÍNDICE
CAPÍTULO I
INTRODUCCIÓN

1

ANTECEDENTES

1

CONCEPTOS GENERALES

2

Aminoácidos.

2

Enlacepeptídico.

4

Racemización.

4

CAPÍTULO II
GRUPOS PROTECTORES

5

Grupos protectores del α-amino.

5

Grupos protectores del α-carboxilo.

10

Protección de las cadenas laterales.

12

CAPÍTULO III
FORMACIÓN DEL ENLACE PEPTÍDICO

16

Activación y acoplamiento.

16

Racemización.

20

CAPÍTULO IV
SÍNTESIS DE PÉPTIDOS EN SOLUCIÓN

23
24

Ejemplos de péptidossintetizados en solución.
CAPÍTULO V
SÍNTESIS DE PÉPTIDOS EN FASE SÓLIDA

27

La técnica de Merrifield.

27

La técnica de Sheppard.

29

El soporte sólido.

31

Agentes espaciadores del péptido y la resina.

33

Instrumentación.

36

CAPÍTULO VI
CASOS ESPECIALES DE SÍNTESIS

38

Síntesis de péptidos cíclicos.

38

Síntesis de glicopéptidos.

42

Síntesis depéptidos fosforilados.

43

Bibliotecas de péptidos sintéticos.

44

CAPÍTULO VII
PURIFICACIÓN DE PÉPTIDOS

48

Cromatografía de alta resolución (HPLC).

48

ii

SÍNTESIS DE PÉPTIDOS

CAPÍTULO VII
HERRAMIENTAS PARA LA CARACTERIZACIÓN DE PÉPTIDOS SINTÉTICOS

50

Análisis de aminoácidos.

50

Degradación de Edman.

51

Electroforesis capilar.

52Espectrometría de masas.

52

BIBLIOGRAFÍA

54

Índice de tablas
Tabla 1. Estructura de los 20 aminoácidos encontrados en las proteínas.

3

Tabla 2. Aminoácidos 1-5

25

Tabla 3. Aminoácidos 6-13

25

Tabla 4. Aminoácidos 14-17

26

Índice de figuras
Figura 1. Uretano o carbamato.

6

Figura 2. Protección de un aminoácido por cloruro de carbobenzóxilo.

6

Figura 3.Desprotección de un Z-aminoácido con HBr en ácido acético frío.

6

Figura 4. Desprotección de un Z-aminoácido por hidrogenación catalítica.

7

Figura 5. Los Boc-aminoácidos se obtienen a partir del anhídrido terbutílico

7

Figura 6. Desprotección de un Boc-aminoácido con TFA.

8

Figura 7. Grupo protector Bpoc.

8

Figura 8. Grupo protector Fmoc.

8

Figura 9. Desprotección de unFmoc-aminoácido con piperidina.

9

Figura 10. Obtención de un Trt-aminoácido.

9

Figura 11. Desprotección de un Trt-aminoácido con ácido acético.

10

Figura 12. Preparación de un t-butil éster a partir de un Z-aminoácido.

11

Figura 13. Protección selectiva del α-amino mediante el bloqueo del ε-amino con
benzaldheído.

13

Figura 14. Protección selectiva del ε-aminomediante la formación de un quelato.

13

Figura 15. Protección selectiva de los grupos carboxilo de las cadenas laterales de los
aminoácidos ácidos.

14

Figura 16. Ejemplos de grupos protectores usados para la cadena lateral del aminoácido

14
iii

SÍNTESIS DE PÉPTIDOS

cisteína.
Figura 17. La racemización no se evitará si el grupo protector está en el Nσ.

15

Figura 18.Generación del enlace peptídico por aminólisis.

16

Figura 19. Formación del enlace peptídico por acil azidas.

17

Figura 20. Aminólisis de anhídridos mixtos.

17

Figura 21. Anhídrido derivado del ácido piváltico.

18

Figura 22. Formación del enlace peptídico por un anhídrido carboxílico-carbónico
intermediario.

18

Figura 23. Generación del enlace peptídico po un anhídridointermediario formado a partir
de un aminoácido con ácido difenilfosfínico.

19

Figura 24. Formación de O-acilurea.

19

Figura 25. Formación del enlace peptídico usando BOP como reactivo activador.

20

Figura 26. Racemización por enolización directa.

21

Figura 27. Racemización por formación de una oxazolona.

22

Figura 28. Estrategias para la síntesis de un péptido....