Diseño

Introducción al diseño de Fármacos J.C. Escalona, R. Carrasco, J. A. Padrón
Folleto para la docencia de la asignatura de Farmacia, Universidad de Oriente.

INDICE
I. II II.1 II.1.1 II.1.2 II.1.3 Introducción _________________________________________________ 1 Capítulo I. Diseño de Fármacos. Métodos Tradicionales. _____________ 4 Métodos Variacionales _______________________________________ 4Búsqueda del compuesto líder o cabeza de serie ____________________ 5 El desarrollo de un compuesto líder: La variación molecular. __________ 6 Método Variacional. Tipo de aplicación. __________________________ 8

II.1.3.1 Sustitución bioisostéricas ______________________________________ 8 II.1.3.2 Modulación Molecular ________________________________________ 9 III. III.1 Capitulo II. Diseñode fármacos asistido por computadoras. ___________ 12 Técnicas SAR o modulación molecular en el desarrollo de nuevos Fármacos. __________________________________________________ 12 III.1.1 Búsqueda del farmacóforo. _____________________________________13

III.1.1.1 Búsqueda del farmacóforo cuando no se conoce la estructura del receptor. ____________________________________________________13III.1.1.2 Búsqueda del farmacóforo cuando se conoce la estructura del receptor. ___14 III.1.2 III.2 III.2.1 III.2.2 Consideraciones finales. ________________________________________ 16 Técnicas QSAR en el desarrollo de nuevos fármacos. _________________ 17 Elección de la serie. ___________________________________________ 19 Tipos de estudios QSAR. _______________________________________ 20III.2.2.1 QSAR Tradicional. ____________________________________________ 20 III.2.2.2 QSAR por redes de neuronas. ____________________________________ III.2.2.3 QSAR tridimensional (3D-QSAR). ________________________________ III.2.3 III.2.4 Validación del modelo. __________________________________________ Descriptores moleculares o índices. ________________________________

III.2.4.1 Indices basados enpropiedades químico-físicas. ______________________ III.2.4.2 Indices mecánico-cuánticos. ______________________________________ III.2.4.3 Indices topológicos y topográficos. _________________________________

III.2.5 III.2.6

Criterios de selección de parámetros. _______________________________ Situción actual y tendencias futuras. ________________________________

I.

INTRODUCCION

Lahistoria del medicamento se remonta a los orígenes de la sociedad humana. Desde los primeros tiempos el hombre a acudido a la naturaleza para obtener sustancias que o bien le ayudaran a paliar su dolor, los síntomas de sus enfermedades... o bien le facilitaran la obtención del alimento (veneno para la caza), sus relaciones sociales y religiosas (estimulantes y alucinógenos) etc. Estacircunstancia ha permitido disponer de una amplia información, que sometida a la observación atenta y estudio crítico, ha dado lugar al planteamiento de ideas que, debidamente desarrolladas, han llevado a la obtención de nuevos medicamentos, de sustancias líderes. Esta historia previa es la causa de que en la actualidad el modelo de aproximadamente la mitad de los productos de que se dispone sea de origennatural. Modelos que, obtenidos a partir de un organismo vivo, han sufrido diferentes modificaciones en el laboratorio, encaminadas a obtener moléculas más potentes y menos tóxicas que las originales, las cuales en realidad no habían sido diseñadas para un tratamiento específico. El descubrimiento de un nuevo medicamento y desarrollo posterior del mismo, son dos fases, que condicionan lograr un nuevoproducto que sea útil en la terapéutica. El descubrimiento debe ser diferenciado del desarrollo. Se ha acordado de manera general que el descubrimiento comprende toda la fase para que podamos asegurar que el compuesto tiene un deseable perfil de actividad; comprende desde la síntesis, el aislamiento de la fuente natural, o la obtención biotecnológica y toda la fase preclínica, incluida la...