Gentica vegetal

Bloque III: Análisis de moléculas.

Metabolómica y análisis comparativo de muestras

Organizado por:

- Prof. Javier Abadía y Dra. Ana Mª Alvarez
Dept. Plant Nutrition, Estación Experimental Aula Dei (CSIC)

Zaragoza, 8 de julio de 2009
Isidro Masana Agilent Technologies Especialista Productos LC/MS División Biociencia y Análisis Químico
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Metabolómica y comparación de muestras07/07/2009

La Espectrometría de Masas, una Herramienta Esencial en Metabolómica y Análisis Comparativo de Muestras

LC-MS

ICP-MS GC-MS

Mass Spec/tacular
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Isidro Masana Agilent Technologies Especialista Productos LC/MS División Biociencia y Análisis Químico
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PROGRAMA:

La Espectrometría de Masas, una HerramientaEsencial en Metabolómica y Análisis Comparativo de Muestras

1.- Breve Introducción a la Metabolómica. 2.- Requisitos Analíticos e Instrumentación Requerida 3.- Fases de un Estudio Metabolómico por MS. 4.- Introducción al Software Requerido en un Estudio Metabolómico por MS 5.- Ejemplos de Resultados.

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1.- Introducción a la MetabolómicaLa Espectrometría de Masas, una Herramienta Esencial en Metabolómica y Análisis Comparativo de Muestras

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¿Qué es la Metabolómica?
Metabolómica es el estudio sistemático de las pequeñas moléculas orgánicas (metabolitos) presentes en un sistema biológico Utiliza el análisis estadístico multivariante para correlacionar:
-variaciones en la concentración de metabolitos. - con distintas propiedades de 2 o más grupos de muestras comparadas (organismo, órgano, tejido, célula, fluido,…).
¿Cuales son las diferencias en su composición química que se correlacionan con las diferencias observadas?

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Las 4 “Piedras Angulares” de una Célula Viva Soluciones Agilenten Hardware y Software
2.-Transcriptoma
- Gene Expression Arrays: SplicingArrays - GeneSpring GX Resolver

1.- Genoma

RNA DNA

- aCGH Arrays ChIP on Chip Arrays - GS Genotyping CGH Analytics ChIP Analytics

Proteínas
3.- Proteoma
Técnica análisis:

CH2OH

LC/MS Spectrum Mill y GeneSpring MS
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Metabolitos
Metabolómica comparte: Instrumentación LC/MS con ProteómicaBioinformática GeneSpring con Prot. & Genómica

4.- Metaboloma
Técnica análisis:

LC/MS & GC/MS
GeneSpring MS
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Aportaciones de la Metabolómica en Investigación Agroalimentaria
- Mejorar el Rendimiento de las Cosechas:
• Mejorar su producción. • Mejorar su tolerancia a productos fitosanitarios • Mejorar su resistencia a sequías, a pesticidas,… • Mejorar su valor nutricional.

- Optimizar el tratamiento de Alimentos
• Mejorar su valor nutricional. • minimizar la formación de tóxicos • optimizar el uso de ingredientes, nutrientes y aditivos

- Mejorar las propiedades funcionales de alimentos - Evaluar el impacto de la nutrición en los procesos biológicos y patológicos.
- ……

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Objetivos en Investigación Biomédica
- Identificación de nuevos BIOMARCADORES para diagnóstico precoz de enfermedades - Evolucionar Medicina diagnóstico-curativa (basada en el tratamiento de la enfermedad) Medicina que promueva la salud (evite la enfermedad)
- Requiere el desarrollo de una Medicina: Predictiva, Preventiva, Personalizada, Participativa - Requiere un detalladoconocimiento de los procesos biológicos/ bioquímicos que tienen lugar en el organismo y como éstos están influenciados por:
- el desarrollo de una enfermedad - la ingesta de un fármaco - la alimentación/ dieta seguidas

- Se deberá estudiar el impacto de estos factores en el perfil del genoma, proteoma y metaboloma del organismo. • ……
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