Métodos para cuantificar y visualizar proteínas

UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO
FACULTAD DE CIENCIAS
Biología molecular de la célula I (Laboratorio)
Examen parcial N° 1 Grupo 5036

1. Describe detalladamente un método para la extracción de proteínas basándose en sus propiedades (mínimo 4 propiedades de las proteínas).

Métodos cromatográficos para separación de proteínas

Las separaciones cromatográficos se basan en lasdiferencias de carga tamaño o afinidad de las diferentes proteínas. Uno de los métodos más habitualmente utilizados para la separación de proteínas es la cromatografía en columna, aunque también existe la cromatografía en papel y en placa. La columna está rellena con un material sólido con las características químicas adecuadas (fase estacionaria), y una solución tamponada se hace pasar a través de lacolumna (fase móvil). El extracto crudo se aplica en la parte superior de la columna y va poco a poco entrando en la columna con la fase móvil. Cada proteína migrará a distinta velocidad según su grado de afinidad por la fase estacionaria. Generalmente estas cromatografías se realizan de una forma semiautomática, la fase móvil se hace pasar a la columna a través de una bomba peristáltica y uncolector de fracciones va recogiendo el eluyente que sale de columna. Este colector hace que el tubo vaya cambiando cada cierto número de gotas o de volumen. Después hay que localizar en que tubo o tubos está la proteína que se pretende purificar.

Existen distintos tipos de cromatografías en tres ellos:
• La filtración o exclusión molecular
• El cromatografía de intercambio iónico
• Lacromatografía hidrofobica
• La cromatografía de afinidad

Filtración en gel o cromatografía de exclusión molecular.

La fase estacionaria está constituida por partículas de polímeros de diferente porosidad. La separación se basa en el tamaño de las partículas. Las proteínas más grandes que no pueden penetrar en los poros de las partículas de la matriz de filtración son eluidas con más rapidez que lasproteínas más pequeñas que penetran por los poros de las partículas y siguen un camino más tortuoso y más largo. El tamaño de los poros internos depende de la naturaleza del polímero en cuestión, y permite la entrada a proteínas por debajo de un determinado peso molecular.

Cromatografía de intercambio iónico.

En ella, la columna está rellena con un soporte al que van unidos grupos cargadospositivamente (intercambio aniónico) o negativamente (intercambio catiónico). Estos grupos cargados normalmente están neutralizados por iones del tampón. Estos iones son reversiblemente reemplazados por las proteínas con más tendencia a unirse al soporte. Las proteínas cargadas pueden por lo tanto unirse a intercambiadores catiónicos o aniónicos dependiendo de su carga neta. Las proteínas máscargadas se unirán más fuertemente al intercambiador y por lo tanto serán más difíciles de eluir. La afinidad con la que una proteína se une a un intercambiador iónico depende de la fuerza iónica del medio, debido a la competencia entre los grupos cargados de la proteína y los iones de la fase móvil. Una vez pegadas las proteínas, para eluirlas (retirarlas) de la columna, se suele ir subiendo lafuerza iónica de la fase móvil (aumentando la concentración de sal, NaCl), de esta forma se eluyen primero las proteínas mas débilmente retenidas y cuando la fuerza iónica sea mayor saldrán las proteínas más cargadas y por lo tanto más retenidas.


Cromatografía hidrofóbica.

Se trata de un método similar al anterior con la única diferencia de que la fase estacionaria es apolar (hidrofóbica),es decir, la proteína se pega al soporte por los resto de aminoácidos apolares, cuanto más residuos de este tipo tenga en su superficie, más apolar será, más se retendrá en la columna y se eluirá más tarde. En este caso a elusión se realiza aumentando la apolaridad de fase móvil.


Cromatografía de afinidad.
Muchas proteínas tienen la capacidad de unirse específicamente a ciertas moléculas,...